Dominio HMG box

Il dominio HMG box (High Mobility Group box) è un dominio di legame al DNA che caratterizza una famiglia di proteine architetturali. Il nome deriva dalle proteine HMG, identificate per l’elevata mobilità elettroforetica.


Struttura e modo di legame (cosa lo distingue)

  • È composto da ~80 amminoacidi ripiegati in tre α-eliche che formano una caratteristica struttura a “L”.
  • A differenza della maggior parte dei fattori (che leggono il solco maggiore), l’HMG box si inserisce nel solco minore del DNA.
  • Conseguenza chiave: piega fortemente la doppia elica (fino a 90°). Per questo le proteine HMG box sono dette fattori architetturali: non attivano direttamente la trascrizione tanto quanto rimodellano la geometria del DNA, avvicinando enhancer e fattori altrimenti distanti per formare un complesso trascrizionale funzionante.

Una grande sottofamiglia è detta SRY-related, perché il capostipite è SRY (Sex-determining Region Y): il fattore codificato dal cromosoma Y che determina lo sviluppo testicolare (fattore di determinazione del sesso maschile). Tutti i fattori SOX (SRY-related HMG box) condividono questo dominio.


Caso specifico: Sox2

Sox2 è il membro SOX centrale per la pluripotenza (vedi Fattori di Trascrizione della Pluripotenza). Tramite il suo HMG box lega un sito adiacente a quello di Oct-4 (Dominio POU) sugli enhancer dei geni della staminalità: piegando il DNA, stabilizza il complesso Oct-4–Sox2 e co-regola i geni-bersaglio della rete di auto-rinnovamento.

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