Legame Fosfodiesterico

Definizione generale

Il legame fosfodiesterico è il legame in cui un singolo gruppo fosfato è unito tramite due legami estere a due distinti gruppi ossidrilici (), facendo da “ponte” fra due molecole.

Un estere è il prodotto della reazione tra un acido e un alcol (gruppo ). Il gruppo fosfato è un acido che possiede più ossidrili: può quindi formare due legami estere contemporaneamente, uno per lato. Da qui il nome fosfo-di-esterico (un fosfato, due esteri).

Come si forma

Si forma per condensazione, con liberazione di una molecola d’acqua, tra il fosfato e i due gruppi ossidrilici. È un legame covalente stabile, alla base degli scheletri (backbone) di DNA e RNA (lo si ritrova anche in molecole come l’AMP ciclico).

Caso specifico: lo scheletro degli acidi nucleici

Negli acidi nucleici il fosfato collega due nucleotidi adiacenti formando il backbone:

  • Primo estere: tra il fosfato e il carbonio 5’ di un nucleotide.
  • Secondo estere: tra lo stesso fosfato e l’ossidrile del carbonio 3’ del nucleotide successivo.

Il fosfato fa quindi da “ponte” . È ciò che rende l’acido nucleico un polimero.

Conseguenza: la polarità del filamento

Poiché ogni legame collega sempre un 5’ a un 3’, la catena ha due estremità chimicamente diverse e non intercambiabili:

  • Estremità 5’: porta un gruppo fosfato libero ().
  • Estremità 3’: porta un ossidrile libero ().

Questa direzionalità () è la base dell’antiparallelismo dei due filamenti e del verso in cui le polimerasi sintetizzano gli acidi nucleici.

🖼️ Immagine da inserire

Schema di due nucleotidi uniti, con il fosfato evidenziato al centro e le due frecce/legami che vanno verso il C5’ sopra e il C3’-OH sotto. Cerca: “phosphodiester bond 3’ 5’ diagram”. L’ideale è una figura che mostri lo scheletro zucchero-fosfato-zucchero con i carboni numerati.

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