Complesso Chiuso e Aperto
Complesso chiuso e complesso aperto sono i due stati attraverso cui passa l’interazione tra RNA polimerasi e promotore prima che la sintesi dell’RNA possa cominciare. Distinguono il legame al DNA dalla disponibilità del filamento stampo nel sito attivo.
Definizione generale
- Complesso chiuso: la polimerasi è ancorata al promotore, ma la doppia elica del DNA è ancora intatta (avvolta). L’enzima è in posizione, ma lo stampo non è accessibile.
- Complesso aperto: le due eliche vengono localmente separate (denaturazione di un breve tratto, ~10–14 bp, attorno al sito di inizio). Si forma la bolla di trascrizione: il filamento stampo è ora esposto nel sito catalitico e può essere copiato.
La transizione chiuso → aperto (isomerizzazione) è il punto che impegna la polimerasi all’inizio della trascrizione.
Come avviene l’apertura — i due casi
- Procarioti: la oloenzima con il fattore σ è in grado di aprire da sola la doppia elica (isomerizzazione spontanea, senza ATP). Vedi RNA Polimerasi Batterica.
- Eucarioti: l’RNA polimerasi II non sa denaturare il DNA da sola. L’apertura richiede l’attività elicasica ATP-dipendente di TFIIH, che consuma ATP per svolgere l’elica e portare il complesso da chiuso ad aperto.
È una delle differenze chiave tra trascrizione procariotica ed eucariotica: nei procarioti l’apertura è intrinseca all’enzima, negli eucarioti è delegata a un fattore generale dedicato.
🔗 Collegamenti
- Complesso di Pre-inizio — 🔗 stesso meccanismo / stessa via
- RNA Polimerasi Batterica — 🔄 diagnosi differenziale / confronto
- Promotore — 🔗 stesso meccanismo / stessa via
- Trascrizione — 📋 fa parte di
- Ciclo di Trascrizione Eucariotica — 🔗 stesso meccanismo / stessa via